Ο Φλιν αναγκάστηκε να παραιτηθεί στις 13 Φεβρουαρίου -έχοντας συμπληρώσει λίγες μέρες στο νέο του αξίωμα- όταν αποκαλύφθηκε πως είχε πει ψέματα για τις συζητήσεις που είχε με τον Ρώσο πρεσβευτή στις ΗΠΑ Σεργκέι Κίσλιακ, πριν από την ορκωμοσία του Τραμπ.

Ο τέως πρόεδρος των ΗΠΑ είχε προβεί στην προειδοποίηση για τον Φλιν κατά τη διάρκεια της πρώτης συνάντησης στο Οβάλ Γραφείο που είχαν ο Δημοκρατικός απερχόμενος τότε πρόεδρος και ο Ρεπουμπλικάνος διάδοχός του στις 10 Νοεμβρίου, συμπλήρωσε ο συνεργάτης, που μίλησε υπό τον όρο να μην κατονομαστεί.

Η προειδοποίηση, την οποία μετέδωσε πρώτο το ειδησεογραφικό τηλεοπτικό δίκτυο NBC, έγινε κατά τη διάρκεια συζήτησης για το προσωπικό του Λευκού Οίκου.

Δεν έχει σαφές ποια ήταν η προέλευση των αμφιβολιών του Ομπάμα για τον Φλιν.