Ο πολυνίκης προπονητής άφησε την τελευταία πνοή του έπειτα από μάχη με προβλήματα υγείας που τον ταλαιπωρούσαν τα τελευταία χρόνια.
Ο Γιάννης Ιωαννίδης αν και είχε καταγωγή από τη Θεσσαλονίκη και συνέδεσε το όνομά του με τον Άρη, έμενε μόνιμα στην Αθήνα μαζί με την σύζυγό του και την κόρη τους.
