Ποινική δίωξη σε βαθμό κακουργήματος σε βάρος στελεχών της ΤΡΑΙΝΟΣΕ ασκήθηκε από την Εισαγγελία Πρωτοδικών Αθηνών.

Η δίωξη συνδέεται με το αδίκημα απιστίας στην υπηρεσία, τελεσθείσας κατ' εξακολούθηση και αφορά την εκμίσθωση από την ΤΡΑΙΝΟΣΕ ακινήτων που δεν είχαν μεταβιβαστεί σε αυτήν με κανένα νόμιμο τρόπο από τον ΟΣΕ, και μάλιστα αντί ευτελούς τιμήματος.