Στελέχη του Αρχηγείου του Λιμενικού υποστήριζαν πάντως ότι στο γραφείο του Οργανισμού στον Πειραιά που λειτουργεί από το 2010 σε πιλοτική βάση δεν θα μπει «λουκέτο».

Σύμφωνα με πληροφορίες του ΑΠΕ-ΜΠΕ αξιωματούχοι του Frontex προσανατολίζονται στο να προτείνουν το μετασχηματισμό του σε μια νέα δομή που δεν θα ασχολείται με τη διαχείριση των συνόρων, αλλά με την αντιμετώπιση των προσφυγικών ροών και των μεταναστών.

Μία τέτοια απόφαση ωστόσο επισημαίνουν στελέχη από το υπουργείο Ναυτιλίας θεωρείται αυθαίρετη και αναμένεται να καταβληθούν προσπάθειες από τις ελληνικές αρχές προκειμένου να αποφευχθεί ένα τέτοιο ενδεχόμενο.

Σύμφωνα με τον ιδρυτικό Κανονισμό της, η Ευρωπαϊκή Υπηρεσία για τη διαχείριση της επιχειρησιακής συνεργασίας στα εξωτερικά σύνορα των κ-μ της Ε.Ε. (FRONTEX) έχει σκοπό την ολοκληρωμένη και αποτελεσματική διαχείριση των εξωτερικών συνόρων (χερσαίων, θαλασσίων και εναερίων) των Κ-Μ της Ε.Ε., με συντονισμό των κοινών δράσεων και παροχή της αναγκαίας τεχνικής συνδρομής και τεχνογνωσίας. Λειτουργεί από 1.10.2005, με έδρα τη Βαρσοβία.