Στόχος του ΕλΙδΕΚ είναι κατά κύριο λόγο η χρηματοδότηση ερευνητικών προγραμμάτων και η χορήγηση υποτροφιών. Δικαιούχοι των χρηματοδοτήσεων θα είναι τα ΑΕΙ και οι δημόσιοι ερευνητικοί και τεχνολογικοί φορείς της χώρας.

Όπως αναφέρεται, σε πρώτη φάση το ΕλΙδΕΚ θα διαχειριστεί κονδύλια ύψους 240 εκατ. ευρώ τα οποία, όπως έχει ήδη δημοσιευθεί, προέρχονται, βάσει συμφωνίας, από την Ελληνική Τράπεζα Επενδύσεων (ΕΤΕπ).